Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCF4Q15080 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCF4Q15080 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NCF4Q15080 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NCF4Q15080 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NCF4Q15080 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NCF4Q15080 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCF4Q15080 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCF4Q15080 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCF4Q15080 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCF4Q15080 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCF4Q15080 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCF4Q15080 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCF4Q15080 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCF4Q15080 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NCF4Q15080 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCF4Q15080 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCF4Q15080 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCF4Q15080 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms