Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KIAA0040Q15053 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KIAA0040Q15053 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KIAA0040Q15053 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIAA0040Q15053 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KIAA0040Q15053 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA0040Q15053 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA0040Q15053 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA0040Q15053 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIAA0040Q15053 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIAA0040Q15053 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIAA0040Q15053 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KIAA0040Q15053 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KIAA0040Q15053 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KIAA0040Q15053 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIAA0040Q15053 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KIAA0040Q15053 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIAA0040Q15053 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KIAA0040Q15053 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KIAA0040Q15053 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIAA0040Q15053 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIAA0040Q15053 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIAA0040Q15053 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIAA0040Q15053 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIAA0040Q15053 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIAA0040Q15053 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms