Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms