Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SMC1AQ14683 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SMC1AQ14683 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SMC1AQ14683 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMC1AQ14683 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SMC1AQ14683 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC1AQ14683 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SMC1AQ14683 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC1AQ14683 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SMC1AQ14683 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMC1AQ14683 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SMC1AQ14683 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC1AQ14683 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC1AQ14683 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC1AQ14683 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC1AQ14683 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC1AQ14683 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC1AQ14683 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC1AQ14683 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC1AQ14683 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC1AQ14683 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC1AQ14683 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC1AQ14683 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMC1AQ14683 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMC1AQ14683 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMC1AQ14683 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMC1AQ14683 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMC1AQ14683 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMC1AQ14683 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMC1AQ14683 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMC1AQ14683 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMC1AQ14683 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SMC1AQ14683 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMC1AQ14683 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMC1AQ14683 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMC1AQ14683 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMC1AQ14683 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMC1AQ14683 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMC1AQ14683 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
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