Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAT1Q14517 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAT1Q14517 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAT1Q14517 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAT1Q14517 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAT1Q14517 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAT1Q14517 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAT1Q14517 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAT1Q14517 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAT1Q14517 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAT1Q14517 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAT1Q14517 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAT1Q14517 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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