Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms