Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBM39Q14498 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM39Q14498 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM39Q14498 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM39Q14498 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM39Q14498 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM39Q14498 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBM39Q14498 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBM39Q14498 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM39Q14498 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM39Q14498 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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