Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIDRQ14159 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPIDRQ14159 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPIDRQ14159 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPIDRQ14159 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPIDRQ14159 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPIDRQ14159 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIDRQ14159 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPIDRQ14159 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIDRQ14159 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIDRQ14159 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIDRQ14159 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPIDRQ14159 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPIDRQ14159 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPIDRQ14159 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIDRQ14159 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIDRQ14159 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPIDRQ14159 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms