Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPSNQ13702 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAPSNQ13702 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAPSNQ13702 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAPSNQ13702 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAPSNQ13702 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAPSNQ13702 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAPSNQ13702 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPSNQ13702 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RAPSNQ13702 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAPSNQ13702 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAPSNQ13702 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAPSNQ13702 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAPSNQ13702 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAPSNQ13702 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAPSNQ13702 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAPSNQ13702 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAPSNQ13702 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAPSNQ13702 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPSNQ13702 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPSNQ13702 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms