Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL3Q13618 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL3Q13618 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL3Q13618 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL3Q13618 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL3Q13618 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL3Q13618 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL3Q13618 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL3Q13618 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL3Q13618 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CUL3Q13618 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL3Q13618 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL3Q13618 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL3Q13618 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL3Q13618 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL3Q13618 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL3Q13618 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CUL3Q13618 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL3Q13618 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL3Q13618 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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