Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRQ13535 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRQ13535 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRQ13535 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRQ13535 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRQ13535 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRQ13535 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRQ13535 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRQ13535 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRQ13535 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRQ13535 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRQ13535 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRQ13535 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRQ13535 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATRQ13535 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRQ13535 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRQ13535 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRQ13535 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRQ13535 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRQ13535 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRQ13535 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRQ13535 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRQ13535 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRQ13535 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRQ13535 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRQ13535 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRQ13535 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRQ13535 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRQ13535 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRQ13535 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRQ13535 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRQ13535 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRQ13535 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRQ13535 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRQ13535 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRQ13535 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRQ13535 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRQ13535 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRQ13535 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRQ13535 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRQ13535 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRQ13535 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRQ13535 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRQ13535 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRQ13535 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRQ13535 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRQ13535 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRQ13535 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRQ13535 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRQ13535 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRQ13535 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRQ13535 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRQ13535 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRQ13535 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATRQ13535 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRQ13535 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRQ13535 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRQ13535 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRQ13535 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRQ13535 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRQ13535 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRQ13535 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATRQ13535 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRQ13535 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRQ13535 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRQ13535 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRQ13535 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRQ13535 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRQ13535 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRQ13535 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRQ13535 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRQ13535 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRQ13535 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRQ13535 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRQ13535 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRQ13535 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms