Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK2Q13002 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIK2Q13002 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIK2Q13002 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIK2Q13002 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIK2Q13002 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK2Q13002 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK2Q13002 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIK2Q13002 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIK2Q13002 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIK2Q13002 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIK2Q13002 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIK2Q13002 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIK2Q13002 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIK2Q13002 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK2Q13002 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK2Q13002 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIK2Q13002 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIK2Q13002 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIK2Q13002 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK2Q13002 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK2Q13002 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK2Q13002 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK2Q13002 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK2Q13002 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIK2Q13002 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK2Q13002 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK2Q13002 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK2Q13002 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK2Q13002 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK2Q13002 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK2Q13002 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK2Q13002 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK2Q13002 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GRIK2Q13002 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK2Q13002 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK2Q13002 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK2Q13002 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK2Q13002 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIK2Q13002 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK2Q13002 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
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