Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROAPQ12815 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TROAPQ12815 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TROAPQ12815 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROAPQ12815 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TROAPQ12815 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TROAPQ12815 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TROAPQ12815 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROAPQ12815 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TROAPQ12815 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TROAPQ12815 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROAPQ12815 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TROAPQ12815 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROAPQ12815 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROAPQ12815 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TROAPQ12815 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROAPQ12815 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TROAPQ12815 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TROAPQ12815 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROAPQ12815 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TROAPQ12815 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TROAPQ12815 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROAPQ12815 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TROAPQ12815 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TROAPQ12815 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TROAPQ12815 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TROAPQ12815 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROAPQ12815 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TROAPQ12815 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TROAPQ12815 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROAPQ12815 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TROAPQ12815 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TROAPQ12815 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TROAPQ12815 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TROAPQ12815 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TROAPQ12815 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
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