Protein–RNA interactions for Protein: Q06250

WT1-AS, Putative Wilms tumor upstream neighbor 1 gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WT1-ASQ06250 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WT1-ASQ06250 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WT1-ASQ06250 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WT1-ASQ06250 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WT1-ASQ06250 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WT1-ASQ06250 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WT1-ASQ06250 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WT1-ASQ06250 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
WT1-ASQ06250 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WT1-ASQ06250 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WT1-ASQ06250 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
WT1-ASQ06250 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WT1-ASQ06250 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WT1-ASQ06250 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WT1-ASQ06250 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms