Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUCB1Q02818 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NUCB1Q02818 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUCB1Q02818 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUCB1Q02818 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUCB1Q02818 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUCB1Q02818 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUCB1Q02818 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUCB1Q02818 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUCB1Q02818 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUCB1Q02818 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUCB1Q02818 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NUCB1Q02818 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NUCB1Q02818 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUCB1Q02818 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NUCB1Q02818 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUCB1Q02818 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NUCB1Q02818 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NUCB1Q02818 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NUCB1Q02818 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUCB1Q02818 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NUCB1Q02818 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUCB1Q02818 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NUCB1Q02818 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUCB1Q02818 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUCB1Q02818 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUCB1Q02818 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUCB1Q02818 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUCB1Q02818 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NUCB1Q02818 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUCB1Q02818 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NUCB1Q02818 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUCB1Q02818 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUCB1Q02818 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUCB1Q02818 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUCB1Q02818 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NUCB1Q02818 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUCB1Q02818 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms