Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MUC3AQ02505 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MUC3AQ02505 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MUC3AQ02505 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MUC3AQ02505 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MUC3AQ02505 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MUC3AQ02505 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MUC3AQ02505 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MUC3AQ02505 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MUC3AQ02505 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MUC3AQ02505 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MUC3AQ02505 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MUC3AQ02505 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MUC3AQ02505 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MUC3AQ02505 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MUC3AQ02505 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MUC3AQ02505 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MUC3AQ02505 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MUC3AQ02505 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MUC3AQ02505 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MUC3AQ02505 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MUC3AQ02505 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MUC3AQ02505 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
MUC3AQ02505 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MUC3AQ02505 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MUC3AQ02505 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MUC3AQ02505 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MUC3AQ02505 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MUC3AQ02505 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MUC3AQ02505 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MUC3AQ02505 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MUC3AQ02505 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MUC3AQ02505 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MUC3AQ02505 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MUC3AQ02505 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MUC3AQ02505 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MUC3AQ02505 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MUC3AQ02505 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MUC3AQ02505 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MUC3AQ02505 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MUC3AQ02505 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MUC3AQ02505 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MUC3AQ02505 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MUC3AQ02505 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MUC3AQ02505 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MUC3AQ02505 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MUC3AQ02505 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MUC3AQ02505 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MUC3AQ02505 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MUC3AQ02505 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MUC3AQ02505 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MUC3AQ02505 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MUC3AQ02505 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MUC3AQ02505 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MUC3AQ02505 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MUC3AQ02505 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MUC3AQ02505 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms