Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SATB1Q01826 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SATB1Q01826 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SATB1Q01826 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SATB1Q01826 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SATB1Q01826 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SATB1Q01826 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SATB1Q01826 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SATB1Q01826 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SATB1Q01826 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SATB1Q01826 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SATB1Q01826 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SATB1Q01826 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SATB1Q01826 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SATB1Q01826 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SATB1Q01826 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SATB1Q01826 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SATB1Q01826 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SATB1Q01826 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SATB1Q01826 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SATB1Q01826 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SATB1Q01826 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SATB1Q01826 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
SATB1Q01826 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SATB1Q01826 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SATB1Q01826 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SATB1Q01826 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SATB1Q01826 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SATB1Q01826 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SATB1Q01826 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SATB1Q01826 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SATB1Q01826 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms