Protein–RNA interactions for Protein: Q01113

IL9R, Interleukin-9 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL9RQ01113 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IL9RQ01113 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IL9RQ01113 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IL9RQ01113 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IL9RQ01113 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IL9RQ01113 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IL9RQ01113 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
IL9RQ01113 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IL9RQ01113 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IL9RQ01113 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IL9RQ01113 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IL9RQ01113 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms