Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTG1P63261 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTG1P63261 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTG1P63261 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTG1P63261 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTG1P63261 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTG1P63261 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTG1P63261 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTG1P63261 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTG1P63261 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTG1P63261 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTG1P63261 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTG1P63261 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTG1P63261 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTG1P63261 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTG1P63261 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms