Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMC1P62191 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMC1P62191 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMC1P62191 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMC1P62191 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMC1P62191 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMC1P62191 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMC1P62191 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMC1P62191 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMC1P62191 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMC1P62191 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMC1P62191 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC1P62191 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC1P62191 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC1P62191 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMC1P62191 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC1P62191 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMC1P62191 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC1P62191 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC1P62191 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMC1P62191 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC1P62191 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC1P62191 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC1P62191 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC1P62191 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC1P62191 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC1P62191 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC1P62191 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC1P62191 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC1P62191 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC1P62191 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC1P62191 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC1P62191 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMC1P62191 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms