Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS3AP61247 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS3AP61247 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS3AP61247 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS3AP61247 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS3AP61247 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS3AP61247 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS3AP61247 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS3AP61247 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS3AP61247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS3AP61247 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS3AP61247 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS3AP61247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS3AP61247 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS3AP61247 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS3AP61247 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms