Protein–RNA interactions for Protein: P61225

RAP2B, Ras-related protein Rap-2b, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP2BP61225 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAP2BP61225 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAP2BP61225 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP2BP61225 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAP2BP61225 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAP2BP61225 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAP2BP61225 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAP2BP61225 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAP2BP61225 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP2BP61225 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAP2BP61225 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP2BP61225 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAP2BP61225 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAP2BP61225 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAP2BP61225 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAP2BP61225 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAP2BP61225 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAP2BP61225 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAP2BP61225 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAP2BP61225 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAP2BP61225 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAP2BP61225 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP2BP61225 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAP2BP61225 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms