Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERVPABLB-1P60509 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVPABLB-1P60509 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERVPABLB-1P60509 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ERVPABLB-1P60509 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVPABLB-1P60509 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVPABLB-1P60509 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVPABLB-1P60509 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVPABLB-1P60509 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERVPABLB-1P60509 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVPABLB-1P60509 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVPABLB-1P60509 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVPABLB-1P60509 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVPABLB-1P60509 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVPABLB-1P60509 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVPABLB-1P60509 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVPABLB-1P60509 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERVPABLB-1P60509 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVPABLB-1P60509 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms