Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM11AP58511 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM11AP58511 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SMIM11AP58511 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM11AP58511 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM11AP58511 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM11AP58511 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM11AP58511 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM11AP58511 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM11AP58511 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM11AP58511 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM11AP58511 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM11AP58511 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM11AP58511 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM11AP58511 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM11AP58511 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM11AP58511 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM11AP58511 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMIM11AP58511 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM11AP58511 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM11AP58511 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM11AP58511 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM11AP58511 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM11AP58511 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM11AP58511 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM11AP58511 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMIM11AP58511 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMIM11AP58511 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms