Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB38P57729 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB38P57729 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB38P57729 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB38P57729 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB38P57729 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB38P57729 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB38P57729 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB38P57729 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB38P57729 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB38P57729 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB38P57729 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB38P57729 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB38P57729 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB38P57729 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB38P57729 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB38P57729 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB38P57729 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB38P57729 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB38P57729 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB38P57729 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB38P57729 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB38P57729 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB38P57729 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB38P57729 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB38P57729 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB38P57729 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB38P57729 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB38P57729 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB38P57729 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB38P57729 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB38P57729 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB38P57729 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB38P57729 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB38P57729 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB38P57729 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB38P57729 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB38P57729 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB38P57729 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB38P57729 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB38P57729 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB38P57729 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB38P57729 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB38P57729 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB38P57729 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB38P57729 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB38P57729 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB38P57729 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB38P57729 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB38P57729 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB38P57729 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB38P57729 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB38P57729 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB38P57729 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB38P57729 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB38P57729 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB38P57729 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB38P57729 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB38P57729 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB38P57729 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB38P57729 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB38P57729 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB38P57729 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB38P57729 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB38P57729 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB38P57729 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB38P57729 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB38P57729 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB38P57729 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB38P57729 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB38P57729 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB38P57729 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB38P57729 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB38P57729 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB38P57729 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB38P57729 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB38P57729 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB38P57729 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB38P57729 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB38P57729 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB38P57729 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB38P57729 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB38P57729 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB38P57729 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB38P57729 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB38P57729 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB38P57729 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB38P57729 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB38P57729 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB38P57729 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB38P57729 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB38P57729 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB38P57729 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB38P57729 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB38P57729 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB38P57729 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB38P57729 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB38P57729 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB38P57729 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB38P57729 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms