Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2BFSP57053 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2BFSP57053 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2BFSP57053 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2BFSP57053 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2BFSP57053 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2BFSP57053 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2BFSP57053 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2BFSP57053 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2BFSP57053 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2BFSP57053 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2BFSP57053 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2BFSP57053 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2BFSP57053 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2BFSP57053 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
H2BFSP57053 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2BFSP57053 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2BFSP57053 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2BFSP57053 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2BFSP57053 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2BFSP57053 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2BFSP57053 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2BFSP57053 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2BFSP57053 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2BFSP57053 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2BFSP57053 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms