Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAV3P56539 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAV3P56539 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAV3P56539 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV3P56539 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV3P56539 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAV3P56539 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAV3P56539 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAV3P56539 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAV3P56539 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV3P56539 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV3P56539 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAV3P56539 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV3P56539 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAV3P56539 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV3P56539 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAV3P56539 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV3P56539 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV3P56539 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV3P56539 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV3P56539 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAV3P56539 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAV3P56539 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV3P56539 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAV3P56539 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV3P56539 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV3P56539 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAV3P56539 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAV3P56539 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV3P56539 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAV3P56539 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV3P56539 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV3P56539 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAV3P56539 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAV3P56539 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAV3P56539 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV3P56539 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV3P56539 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV3P56539 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAV3P56539 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAV3P56539 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAV3P56539 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAV3P56539 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAV3P56539 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV3P56539 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV3P56539 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV3P56539 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAV3P56539 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV3P56539 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV3P56539 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV3P56539 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV3P56539 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV3P56539 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV3P56539 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV3P56539 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV3P56539 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV3P56539 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAV3P56539 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAV3P56539 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV3P56539 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV3P56539 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAV3P56539 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAV3P56539 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAV3P56539 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV3P56539 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV3P56539 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV3P56539 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAV3P56539 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV3P56539 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAV3P56539 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAV3P56539 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAV3P56539 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAV3P56539 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAV3P56539 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAV3P56539 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV3P56539 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAV3P56539 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV3P56539 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAV3P56539 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAV3P56539 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV3P56539 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAV3P56539 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV3P56539 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAV3P56539 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAV3P56539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAV3P56539 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAV3P56539 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAV3P56539 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAV3P56539 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAV3P56539 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAV3P56539 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAV3P56539 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAV3P56539 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAV3P56539 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAV3P56539 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAV3P56539 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAV3P56539 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAV3P56539 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAV3P56539 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAV3P56539 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms