Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGALS4P56470 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGALS4P56470 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS4P56470 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS4P56470 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGALS4P56470 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LGALS4P56470 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGALS4P56470 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGALS4P56470 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGALS4P56470 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGALS4P56470 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGALS4P56470 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGALS4P56470 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGALS4P56470 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGALS4P56470 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGALS4P56470 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGALS4P56470 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGALS4P56470 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LGALS4P56470 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGALS4P56470 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms