Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NR1H2P55055 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NR1H2P55055 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1H2P55055 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1H2P55055 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1H2P55055 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H2P55055 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H2P55055 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H2P55055 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1H2P55055 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NR1H2P55055 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NR1H2P55055 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NR1H2P55055 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NR1H2P55055 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1H2P55055 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H2P55055 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1H2P55055 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1H2P55055 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1H2P55055 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1H2P55055 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms