Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMP3P54852 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EMP3P54852 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EMP3P54852 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EMP3P54852 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EMP3P54852 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EMP3P54852 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EMP3P54852 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EMP3P54852 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EMP3P54852 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EMP3P54852 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EMP3P54852 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EMP3P54852 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EMP3P54852 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EMP3P54852 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EMP3P54852 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EMP3P54852 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EMP3P54852 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EMP3P54852 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EMP3P54852 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMP3P54852 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EMP3P54852 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMP3P54852 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EMP3P54852 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EMP3P54852 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EMP3P54852 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMP3P54852 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EMP3P54852 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMP3P54852 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EMP3P54852 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EMP3P54852 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EMP3P54852 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMP3P54852 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EMP3P54852 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMP3P54852 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EMP3P54852 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMP3P54852 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EMP3P54852 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMP3P54852 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EMP3P54852 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EMP3P54852 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMP3P54852 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EMP3P54852 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EMP3P54852 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EMP3P54852 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMP3P54852 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EMP3P54852 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EMP3P54852 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMP3P54852 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMP3P54852 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMP3P54852 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMP3P54852 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EMP3P54852 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EMP3P54852 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EMP3P54852 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EMP3P54852 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMP3P54852 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EMP3P54852 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EMP3P54852 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EMP3P54852 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMP3P54852 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMP3P54852 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EMP3P54852 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EMP3P54852 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EMP3P54852 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EMP3P54852 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMP3P54852 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMP3P54852 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMP3P54852 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMP3P54852 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMP3P54852 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EMP3P54852 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMP3P54852 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMP3P54852 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EMP3P54852 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EMP3P54852 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EMP3P54852 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EMP3P54852 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EMP3P54852 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMP3P54852 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMP3P54852 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EMP3P54852 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EMP3P54852 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMP3P54852 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMP3P54852 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMP3P54852 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EMP3P54852 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EMP3P54852 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EMP3P54852 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMP3P54852 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMP3P54852 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMP3P54852 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMP3P54852 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EMP3P54852 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMP3P54852 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMP3P54852 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMP3P54852 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EMP3P54852 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMP3P54852 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EMP3P54852 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms