Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRLP54845 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NRLP54845 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRLP54845 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRLP54845 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRLP54845 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRLP54845 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRLP54845 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRLP54845 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRLP54845 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRLP54845 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRLP54845 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRLP54845 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRLP54845 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRLP54845 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRLP54845 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRLP54845 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRLP54845 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRLP54845 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRLP54845 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRLP54845 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRLP54845 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRLP54845 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRLP54845 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRLP54845 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRLP54845 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRLP54845 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRLP54845 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRLP54845 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRLP54845 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRLP54845 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRLP54845 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRLP54845 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRLP54845 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRLP54845 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRLP54845 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRLP54845 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRLP54845 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRLP54845 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRLP54845 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRLP54845 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRLP54845 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRLP54845 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRLP54845 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRLP54845 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRLP54845 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRLP54845 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRLP54845 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRLP54845 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRLP54845 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRLP54845 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRLP54845 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRLP54845 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRLP54845 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRLP54845 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRLP54845 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRLP54845 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRLP54845 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NRLP54845 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRLP54845 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRLP54845 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRLP54845 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRLP54845 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRLP54845 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NRLP54845 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRLP54845 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRLP54845 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRLP54845 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRLP54845 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NRLP54845 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NRLP54845 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NRLP54845 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRLP54845 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRLP54845 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRLP54845 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NRLP54845 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NRLP54845 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NRLP54845 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NRLP54845 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRLP54845 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRLP54845 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRLP54845 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NRLP54845 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRLP54845 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NRLP54845 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRLP54845 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRLP54845 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NRLP54845 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRLP54845 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRLP54845 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NRLP54845 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NRLP54845 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRLP54845 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NRLP54845 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRLP54845 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRLP54845 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRLP54845 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRLP54845 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRLP54845 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRLP54845 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms