Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA8P53708 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA8P53708 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA8P53708 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA8P53708 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA8P53708 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA8P53708 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA8P53708 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA8P53708 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA8P53708 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA8P53708 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA8P53708 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA8P53708 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA8P53708 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA8P53708 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA8P53708 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA8P53708 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA8P53708 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA8P53708 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA8P53708 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA8P53708 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA8P53708 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA8P53708 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA8P53708 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA8P53708 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA8P53708 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA8P53708 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGA8P53708 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA8P53708 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA8P53708 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA8P53708 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGA8P53708 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms