Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA1P52907 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA1P52907 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPZA1P52907 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA1P52907 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPZA1P52907 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA1P52907 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPZA1P52907 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA1P52907 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPZA1P52907 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPZA1P52907 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA1P52907 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA1P52907 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA1P52907 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA1P52907 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA1P52907 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPZA1P52907 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA1P52907 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPZA1P52907 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPZA1P52907 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPZA1P52907 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms