Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF138P52744 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF138P52744 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF138P52744 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF138P52744 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF138P52744 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF138P52744 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF138P52744 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF138P52744 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF138P52744 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF138P52744 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF138P52744 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF138P52744 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF138P52744 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF138P52744 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF138P52744 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF138P52744 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF138P52744 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF138P52744 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF138P52744 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms