Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCNN1BP51168 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCNN1BP51168 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCNN1BP51168 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCNN1BP51168 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCNN1BP51168 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCNN1BP51168 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCNN1BP51168 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCNN1BP51168 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCNN1BP51168 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCNN1BP51168 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCNN1BP51168 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCNN1BP51168 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCNN1BP51168 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCNN1BP51168 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCNN1BP51168 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCNN1BP51168 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCNN1BP51168 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCNN1BP51168 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCNN1BP51168 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCNN1BP51168 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCNN1BP51168 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms