Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPT1P50897 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPT1P50897 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPT1P50897 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPT1P50897 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPT1P50897 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPT1P50897 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPT1P50897 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPT1P50897 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPT1P50897 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPT1P50897 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPT1P50897 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPT1P50897 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPT1P50897 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPT1P50897 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPT1P50897 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPT1P50897 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPT1P50897 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPT1P50897 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPT1P50897 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPT1P50897 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPT1P50897 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPT1P50897 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPT1P50897 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPT1P50897 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPT1P50897 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPT1P50897 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPT1P50897 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPT1P50897 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPT1P50897 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPT1P50897 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPT1P50897 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPT1P50897 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPT1P50897 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPT1P50897 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPT1P50897 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPT1P50897 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPT1P50897 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPT1P50897 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPT1P50897 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPT1P50897 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPT1P50897 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPT1P50897 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPT1P50897 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPT1P50897 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPT1P50897 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPT1P50897 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPT1P50897 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPT1P50897 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPT1P50897 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPT1P50897 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPT1P50897 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPT1P50897 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPT1P50897 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPT1P50897 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPT1P50897 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPT1P50897 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPT1P50897 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPT1P50897 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPT1P50897 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPT1P50897 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPT1P50897 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPT1P50897 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPT1P50897 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPT1P50897 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPT1P50897 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPT1P50897 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms