Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLK1P49759 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLK1P49759 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLK1P49759 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLK1P49759 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLK1P49759 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLK1P49759 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLK1P49759 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLK1P49759 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK1P49759 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK1P49759 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK1P49759 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK1P49759 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLK1P49759 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLK1P49759 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLK1P49759 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLK1P49759 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLK1P49759 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLK1P49759 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLK1P49759 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLK1P49759 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLK1P49759 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLK1P49759 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLK1P49759 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLK1P49759 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLK1P49759 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLK1P49759 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLK1P49759 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLK1P49759 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLK1P49759 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLK1P49759 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLK1P49759 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLK1P49759 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLK1P49759 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLK1P49759 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLK1P49759 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLK1P49759 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLK1P49759 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK1P49759 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK1P49759 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK1P49759 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLK1P49759 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK1P49759 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK1P49759 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK1P49759 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK1P49759 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK1P49759 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK1P49759 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK1P49759 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK1P49759 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK1P49759 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK1P49759 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK1P49759 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK1P49759 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK1P49759 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK1P49759 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK1P49759 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK1P49759 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK1P49759 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK1P49759 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK1P49759 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK1P49759 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK1P49759 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK1P49759 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK1P49759 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK1P49759 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK1P49759 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK1P49759 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK1P49759 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK1P49759 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK1P49759 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK1P49759 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK1P49759 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK1P49759 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK1P49759 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK1P49759 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK1P49759 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK1P49759 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK1P49759 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK1P49759 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK1P49759 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK1P49759 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK1P49759 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK1P49759 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK1P49759 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK1P49759 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK1P49759 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK1P49759 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK1P49759 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK1P49759 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLK1P49759 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK1P49759 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK1P49759 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLK1P49759 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLK1P49759 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK1P49759 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK1P49759 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLK1P49759 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK1P49759 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK1P49759 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms