Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC11A1P49279 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC11A1P49279 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC11A1P49279 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC11A1P49279 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC11A1P49279 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC11A1P49279 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC11A1P49279 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC11A1P49279 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC11A1P49279 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC11A1P49279 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC11A1P49279 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SLC11A1P49279 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC11A1P49279 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC11A1P49279 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC11A1P49279 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC11A1P49279 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC11A1P49279 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC11A1P49279 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC11A1P49279 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC11A1P49279 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC11A1P49279 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC11A1P49279 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC11A1P49279 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC11A1P49279 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC11A1P49279 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC11A1P49279 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC11A1P49279 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC11A1P49279 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC11A1P49279 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC11A1P49279 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC11A1P49279 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC11A1P49279 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC11A1P49279 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC11A1P49279 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC11A1P49279 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC11A1P49279 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC11A1P49279 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms