Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CX3CR1P49238 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CX3CR1P49238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CX3CR1P49238 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CX3CR1P49238 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CX3CR1P49238 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CX3CR1P49238 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CX3CR1P49238 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CX3CR1P49238 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CX3CR1P49238 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CX3CR1P49238 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CX3CR1P49238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CX3CR1P49238 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CX3CR1P49238 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CX3CR1P49238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CX3CR1P49238 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CX3CR1P49238 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CX3CR1P49238 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CX3CR1P49238 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CX3CR1P49238 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CX3CR1P49238 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CX3CR1P49238 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CX3CR1P49238 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CX3CR1P49238 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CX3CR1P49238 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CX3CR1P49238 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CX3CR1P49238 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CX3CR1P49238 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CX3CR1P49238 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CX3CR1P49238 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms