Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PXNP49023 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PXNP49023 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PXNP49023 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PXNP49023 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PXNP49023 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PXNP49023 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PXNP49023 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PXNP49023 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PXNP49023 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PXNP49023 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PXNP49023 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PXNP49023 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PXNP49023 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PXNP49023 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PXNP49023 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PXNP49023 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PXNP49023 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PXNP49023 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PXNP49023 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PXNP49023 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PXNP49023 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PXNP49023 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PXNP49023 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PXNP49023 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PXNP49023 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PXNP49023 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PXNP49023 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PXNP49023 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PXNP49023 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PXNP49023 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PXNP49023 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PXNP49023 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PXNP49023 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PXNP49023 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PXNP49023 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PXNP49023 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PXNP49023 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PXNP49023 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PXNP49023 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PXNP49023 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PXNP49023 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PXNP49023 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PXNP49023 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PXNP49023 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PXNP49023 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PXNP49023 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PXNP49023 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PXNP49023 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PXNP49023 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PXNP49023 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXNP49023 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXNP49023 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXNP49023 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PXNP49023 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PXNP49023 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PXNP49023 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PXNP49023 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXNP49023 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXNP49023 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXNP49023 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PXNP49023 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PXNP49023 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PXNP49023 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PXNP49023 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PXNP49023 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PXNP49023 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PXNP49023 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PXNP49023 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PXNP49023 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PXNP49023 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PXNP49023 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PXNP49023 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PXNP49023 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PXNP49023 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PXNP49023 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXNP49023 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXNP49023 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXNP49023 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXNP49023 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PXNP49023 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PXNP49023 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXNP49023 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXNP49023 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXNP49023 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXNP49023 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXNP49023 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PXNP49023 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PXNP49023 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PXNP49023 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PXNP49023 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PXNP49023 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PXNP49023 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PXNP49023 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PXNP49023 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PXNP49023 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PXNP49023 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PXNP49023 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PXNP49023 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PXNP49023 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms