Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD2P49005 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD2P49005 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD2P49005 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD2P49005 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD2P49005 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD2P49005 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD2P49005 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD2P49005 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLD2P49005 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD2P49005 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD2P49005 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD2P49005 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD2P49005 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLD2P49005 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD2P49005 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD2P49005 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD2P49005 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD2P49005 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD2P49005 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD2P49005 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD2P49005 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD2P49005 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD2P49005 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD2P49005 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD2P49005 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD2P49005 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD2P49005 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD2P49005 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD2P49005 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD2P49005 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD2P49005 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD2P49005 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD2P49005 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD2P49005 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD2P49005 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD2P49005 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD2P49005 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD2P49005 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD2P49005 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD2P49005 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD2P49005 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD2P49005 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD2P49005 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD2P49005 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD2P49005 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD2P49005 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD2P49005 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLD2P49005 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD2P49005 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD2P49005 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD2P49005 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD2P49005 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLD2P49005 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLD2P49005 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLD2P49005 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLD2P49005 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLD2P49005 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD2P49005 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD2P49005 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLD2P49005 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLD2P49005 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POLD2P49005 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD2P49005 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLD2P49005 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD2P49005 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD2P49005 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD2P49005 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD2P49005 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD2P49005 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD2P49005 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD2P49005 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD2P49005 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD2P49005 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD2P49005 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD2P49005 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD2P49005 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD2P49005 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLD2P49005 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLD2P49005 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD2P49005 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD2P49005 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD2P49005 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLD2P49005 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLD2P49005 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLD2P49005 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLD2P49005 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD2P49005 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD2P49005 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POLD2P49005 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLD2P49005 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLD2P49005 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD2P49005 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLD2P49005 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD2P49005 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD2P49005 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD2P49005 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLD2P49005 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLD2P49005 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLD2P49005 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms