Protein–RNA interactions for Protein: P48549

KCNJ3, G protein-activated inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ3P48549 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCNJ3P48549 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNJ3P48549 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNJ3P48549 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNJ3P48549 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNJ3P48549 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNJ3P48549 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ3P48549 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ3P48549 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNJ3P48549 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms