Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX2P48431 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOX2P48431 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX2P48431 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX2P48431 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX2P48431 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX2P48431 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX2P48431 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX2P48431 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX2P48431 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX2P48431 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX2P48431 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX2P48431 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX2P48431 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX2P48431 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX2P48431 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX2P48431 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX2P48431 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX2P48431 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX2P48431 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX2P48431 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX2P48431 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX2P48431 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX2P48431 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX2P48431 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX2P48431 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX2P48431 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX2P48431 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX2P48431 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX2P48431 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX2P48431 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX2P48431 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX2P48431 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX2P48431 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX2P48431 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX2P48431 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX2P48431 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX2P48431 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX2P48431 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX2P48431 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX2P48431 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX2P48431 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX2P48431 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX2P48431 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX2P48431 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX2P48431 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX2P48431 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX2P48431 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX2P48431 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX2P48431 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX2P48431 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX2P48431 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX2P48431 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX2P48431 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX2P48431 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX2P48431 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX2P48431 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX2P48431 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX2P48431 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX2P48431 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX2P48431 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX2P48431 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX2P48431 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX2P48431 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX2P48431 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX2P48431 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX2P48431 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX2P48431 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX2P48431 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX2P48431 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX2P48431 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX2P48431 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX2P48431 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX2P48431 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX2P48431 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX2P48431 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX2P48431 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX2P48431 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX2P48431 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX2P48431 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX2P48431 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX2P48431 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX2P48431 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX2P48431 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX2P48431 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SOX2P48431 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SOX2P48431 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX2P48431 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX2P48431 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX2P48431 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SOX2P48431 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX2P48431 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX2P48431 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX2P48431 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SOX2P48431 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX2P48431 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX2P48431 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX2P48431 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX2P48431 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX2P48431 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms