Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ID4P47928 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ID4P47928 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ID4P47928 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ID4P47928 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ID4P47928 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ID4P47928 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ID4P47928 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ID4P47928 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ID4P47928 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ID4P47928 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ID4P47928 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ID4P47928 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ID4P47928 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ID4P47928 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ID4P47928 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ID4P47928 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ID4P47928 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ID4P47928 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ID4P47928 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ID4P47928 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ID4P47928 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ID4P47928 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ID4P47928 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ID4P47928 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ID4P47928 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ID4P47928 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ID4P47928 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ID4P47928 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ID4P47928 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ID4P47928 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ID4P47928 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ID4P47928 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ID4P47928 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ID4P47928 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ID4P47928 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ID4P47928 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ID4P47928 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ID4P47928 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ID4P47928 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ID4P47928 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ID4P47928 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ID4P47928 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ID4P47928 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ID4P47928 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ID4P47928 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ID4P47928 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ID4P47928 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ID4P47928 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ID4P47928 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ID4P47928 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ID4P47928 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ID4P47928 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ID4P47928 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ID4P47928 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ID4P47928 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ID4P47928 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ID4P47928 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ID4P47928 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ID4P47928 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ID4P47928 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ID4P47928 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ID4P47928 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ID4P47928 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ID4P47928 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ID4P47928 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ID4P47928 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ID4P47928 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ID4P47928 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ID4P47928 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ID4P47928 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ID4P47928 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ID4P47928 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ID4P47928 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ID4P47928 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ID4P47928 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ID4P47928 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ID4P47928 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ID4P47928 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ID4P47928 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ID4P47928 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ID4P47928 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ID4P47928 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ID4P47928 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ID4P47928 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ID4P47928 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ID4P47928 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ID4P47928 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ID4P47928 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ID4P47928 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ID4P47928 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ID4P47928 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ID4P47928 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ID4P47928 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ID4P47928 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ID4P47928 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ID4P47928 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ID4P47928 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ID4P47928 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ID4P47928 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms