Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX5P45973 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX5P45973 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX5P45973 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX5P45973 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX5P45973 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX5P45973 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX5P45973 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX5P45973 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX5P45973 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX5P45973 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX5P45973 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX5P45973 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX5P45973 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX5P45973 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX5P45973 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX5P45973 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX5P45973 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX5P45973 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX5P45973 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX5P45973 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX5P45973 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX5P45973 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBX5P45973 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX5P45973 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX5P45973 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX5P45973 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBX5P45973 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBX5P45973 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX5P45973 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBX5P45973 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBX5P45973 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBX5P45973 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX5P45973 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX5P45973 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBX5P45973 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX5P45973 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBX5P45973 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBX5P45973 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBX5P45973 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX5P45973 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX5P45973 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX5P45973 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX5P45973 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX5P45973 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX5P45973 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX5P45973 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX5P45973 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX5P45973 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX5P45973 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX5P45973 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX5P45973 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX5P45973 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX5P45973 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX5P45973 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX5P45973 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX5P45973 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX5P45973 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX5P45973 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX5P45973 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX5P45973 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX5P45973 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX5P45973 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX5P45973 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX5P45973 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX5P45973 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX5P45973 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX5P45973 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX5P45973 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX5P45973 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX5P45973 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX5P45973 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX5P45973 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX5P45973 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX5P45973 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX5P45973 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX5P45973 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX5P45973 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX5P45973 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX5P45973 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX5P45973 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX5P45973 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX5P45973 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX5P45973 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX5P45973 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX5P45973 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX5P45973 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX5P45973 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX5P45973 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX5P45973 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX5P45973 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX5P45973 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX5P45973 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX5P45973 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX5P45973 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX5P45973 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX5P45973 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX5P45973 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX5P45973 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX5P45973 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms