Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARL1P40616 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARL1P40616 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARL1P40616 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARL1P40616 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARL1P40616 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARL1P40616 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL1P40616 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARL1P40616 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARL1P40616 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL1P40616 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARL1P40616 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARL1P40616 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARL1P40616 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL1P40616 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARL1P40616 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL1P40616 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL1P40616 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL1P40616 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARL1P40616 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL1P40616 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL1P40616 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARL1P40616 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL1P40616 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARL1P40616 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARL1P40616 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARL1P40616 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARL1P40616 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARL1P40616 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL1P40616 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL1P40616 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARL1P40616 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL1P40616 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARL1P40616 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARL1P40616 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARL1P40616 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARL1P40616 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARL1P40616 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARL1P40616 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARL1P40616 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL1P40616 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL1P40616 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL1P40616 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL1P40616 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL1P40616 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARL1P40616 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARL1P40616 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARL1P40616 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARL1P40616 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARL1P40616 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARL1P40616 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARL1P40616 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL1P40616 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL1P40616 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL1P40616 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL1P40616 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARL1P40616 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL1P40616 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL1P40616 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL1P40616 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL1P40616 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL1P40616 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL1P40616 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL1P40616 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARL1P40616 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARL1P40616 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARL1P40616 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARL1P40616 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARL1P40616 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARL1P40616 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARL1P40616 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARL1P40616 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARL1P40616 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARL1P40616 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARL1P40616 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARL1P40616 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARL1P40616 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARL1P40616 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARL1P40616 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARL1P40616 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARL1P40616 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARL1P40616 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARL1P40616 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARL1P40616 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARL1P40616 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARL1P40616 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARL1P40616 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARL1P40616 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARL1P40616 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARL1P40616 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ARL1P40616 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARL1P40616 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL1P40616 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARL1P40616 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARL1P40616 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARL1P40616 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARL1P40616 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARL1P40616 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARL1P40616 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARL1P40616 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms