Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACVR1BP36896 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACVR1BP36896 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACVR1BP36896 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACVR1BP36896 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACVR1BP36896 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACVR1BP36896 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1BP36896 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1BP36896 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1BP36896 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACVR1BP36896 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACVR1BP36896 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACVR1BP36896 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1BP36896 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms