Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHI3L1P36222 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHI3L1P36222 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHI3L1P36222 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHI3L1P36222 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHI3L1P36222 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHI3L1P36222 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHI3L1P36222 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L1P36222 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHI3L1P36222 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHI3L1P36222 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHI3L1P36222 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHI3L1P36222 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHI3L1P36222 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHI3L1P36222 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHI3L1P36222 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHI3L1P36222 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHI3L1P36222 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHI3L1P36222 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHI3L1P36222 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHI3L1P36222 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms