Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCD1P33897 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCD1P33897 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCD1P33897 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCD1P33897 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCD1P33897 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCD1P33897 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCD1P33897 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCD1P33897 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCD1P33897 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCD1P33897 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCD1P33897 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCD1P33897 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCD1P33897 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCD1P33897 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCD1P33897 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCD1P33897 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCD1P33897 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCD1P33897 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ABCD1P33897 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCD1P33897 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCD1P33897 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCD1P33897 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCD1P33897 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCD1P33897 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCD1P33897 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCD1P33897 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCD1P33897 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCD1P33897 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCD1P33897 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCD1P33897 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCD1P33897 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCD1P33897 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCD1P33897 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCD1P33897 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms