Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC8A1P32418 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC8A1P32418 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC8A1P32418 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC8A1P32418 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC8A1P32418 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A1P32418 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC8A1P32418 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC8A1P32418 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC8A1P32418 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC8A1P32418 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC8A1P32418 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC8A1P32418 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC8A1P32418 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC8A1P32418 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC8A1P32418 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC8A1P32418 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC8A1P32418 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC8A1P32418 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC8A1P32418 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC8A1P32418 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC8A1P32418 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC8A1P32418 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC8A1P32418 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A1P32418 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A1P32418 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC8A1P32418 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC8A1P32418 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC8A1P32418 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC8A1P32418 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC8A1P32418 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC8A1P32418 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC8A1P32418 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms