Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCSK6P29122 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCSK6P29122 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCSK6P29122 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCSK6P29122 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK6P29122 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK6P29122 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCSK6P29122 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK6P29122 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCSK6P29122 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK6P29122 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCSK6P29122 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCSK6P29122 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK6P29122 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCSK6P29122 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK6P29122 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK6P29122 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK6P29122 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK6P29122 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK6P29122 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK6P29122 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK6P29122 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK6P29122 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK6P29122 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK6P29122 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK6P29122 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK6P29122 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK6P29122 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK6P29122 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK6P29122 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK6P29122 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK6P29122 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK6P29122 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK6P29122 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK6P29122 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK6P29122 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCSK6P29122 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCSK6P29122 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCSK6P29122 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms